海拉尔区第一人民医院
海拉尔区人民医院始建于1956年，2009年医疗资源整合与原海拉尔铁路医院合并，2011年在海拉尔区巴彦托海路东侧新建海拉尔区人民医院综合楼，医院目前已发展为一所集医疗、预防、保健、教学、科研、“120”急救及社区服务于一体的综合性医院，医院建筑面积3.55万平方米，现有开放床位350张，设有38个临床、医技科室。
呼伦贝尔市第二人民医院
呼伦贝尔市传染病院（呼伦贝尔市第二人民医院）位于素有“塞外苏杭”之称的扎兰屯市。是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、急救于一体的三级甲等医院，前身是呼伦贝尔市结核病医院（呼伦贝尔市直属正处级单位）。医院环境优美，占地面积十余万平方米，建筑面积近三万平方米，2018年门诊量达11.5万人次、住院患者近1.1万人次、手术量4600例次。
内蒙古林业总医院
内蒙古林业总医院（内蒙古民族大学附属第二医院）是位于祖国最北端的国家三级甲等医院，坐落在呼伦贝尔草原与大兴安岭林海交汇处的牙克石市，1956年由国家林业部投资建设，是一所集医疗、教学、科研、保健、预防、康复、社区服务为一体的大型现代化综合医院。近年来曾先后获得“全国卫生系统先进集体”、“内蒙古自治区文明单位标兵”、“全国百姓放心示范医院”等荣誉称号。院长张晓光同志被评为“全国先进工作者”、“全国优秀院长”、“享受国务院特殊津贴专家”。
呼伦贝尔市人民医院
呼伦贝尔市人民医院创建于1954年，是一所集医疗急救、科研教学、预防保健、康复指导、健康管理及公共卫生服务为一体的国家三级甲等综合性医院，是国家医疗健康信息互联互通标准化成熟度四级甲等医疗机构，通过“ISO15189”医学实验室质量和能力认可，全国健康管理示范基地，自治区住院医师规范化培训基地，呼伦贝尔市住院医师、全科医师培训基地，苏州大学附属呼伦贝尔医院、苏州大学研究生工作站，内蒙古民族大学呼伦贝尔临床医学院、临床医学硕士研究生培养单位，内蒙古医科大学教学医院、临床医学硕士研究生培养单位，全区普通高等医
呼伦贝尔市蒙医医院
呼伦贝尔市蒙医医院是在原呼伦贝尔蒙医学校门诊部的基础上逐步发展建立的。2008年，内蒙古自治区卫生厅和市编办批准成立呼伦贝尔市蒙医医院，作为全市蒙医药临床、教学、科研中心，按二级甲等医院建设，投资5000万元，占地面积5776平方米，住院综合楼11359平方米，制剂室1975平方米。
鄂伦春自治旗中蒙医院
鄂伦春自治旗中蒙医院座落于鄂伦春自治旗的经济重镇大杨树镇，成立于1977年，其前身系鄂伦春自治旗第二人民医院，经过30几年的建设和发展，已发展成为鄂伦春自治旗唯一一所集医疗、预防、保健、康复、120急诊急救等多项功能于一体的二级乙等公益性中蒙医专科医院。
新巴尔虎右旗人民医院
新巴尔虎右旗人民医院始建于1945年8月，坐落于新巴尔虎右旗乌尔逊大街，经过几代人70余年的不懈努力，已发展成全旗唯一一所集医疗、预防、保健于一体的二级乙等综合性医院，是新巴尔虎右旗医疗技术诊疗中心，肩负着全旗人民群众的医疗、急救任务及辖区内各种突发公共卫生事件的医疗救治工作。
扎兰屯市人民医院
扎兰屯市人民医院是扎兰屯市唯一一所集医疗、预防保健、教学科研为一体的国家三级综合医院、国家级“爱婴医院”。扎兰屯市“120”急救指挥中心、综合产科急救中心、中心血库、感染性疾病科均设在该院。拥有呼伦贝尔市重点学科口腔科、神经外科、骨外科，呼伦贝尔市重点专科产科、医学影像科、眼科，建立了该市首家健康体检科、重症医学科，全市最大的康复医学科。
扎兰屯市中蒙医院
扎兰屯市中蒙医院始建于1956年。现为国家级三级甲等中医医院。是一所具有中蒙医特色的综合性医院。医院建筑面积36000平方米，开设床位500张。医院设有26个临床科室，11个医技科室。其中脑病科、肝病科、肾病科、肛肠科、蒙医胃病、骨伤科为呼伦贝尔市中蒙医重点专科，普外科、儿科、妇产科、超声科为呼伦贝尔市临床重点学科，脑病科是国家农村牧区医疗机构蒙医中医特色优势重点专科项目建设单位，肝病科、肾病科、肛肠科是内蒙古自治区中医特色重点专科项目建设单位。
阿荣旗人民医院
阿荣旗人民医院始建于1949年，前身是阿荣旗卫生院，1958年正式更名为阿荣旗人民医院，现已有60多年的发展历史。从最初的几十名医护人员，单一的诊疗模式，逐步发展成为今天集医疗、教学、科研、预防保健、急救为一体的综合性二级医院，是北京军区总医院帮带医院；北京燕化医院、北京京煤总医院对口支援医院；哈尔滨医科大学、齐齐哈尔市第一医院协作医院；呼伦贝尔市卫校教学医院。医院总资产2.5亿元，其中固定资产9648万元。医院占地面积3万m2，建筑面积4.7万m2。现有编制床位500张，最大可开放床位650张，现有职工
呼伦贝尔市中蒙医院
呼伦贝尔市中蒙医院坐落于风光秀美的草原城市海拉尔西大街繁华地段，是呼市地区较大的一所集中、蒙、西医医疗，科研、教学及预防保健于一体的二级甲等医院。
阿荣旗中蒙医院
阿荣旗中蒙医院始建于1977年，1997年晋升为国家二级甲等专科医院，先后获呼伦贝尔市级“文明单位”、阿荣旗“十佳文明窗口”，2011年被自治区卫生厅评定为“二级甲等”中蒙医综合医院，是职工医疗、城镇居民医疗、新农合、保险公司定点医疗机构。现有职工230人，卫生专业技术人员198人，其中中级以上职称82人。现医院分为门诊楼、住院楼和后勤综合服务中心三部分，占地面积11000平方米，建筑面积8182平方米。